古基因组学说明还可能曲解或否认土著社群的古代历史 ，他们在那里为了确保古基因组学研究符合伦理且互惠互利，先人需怀Bardill等建议，符合然而，伦理科学家们在研究先人遗骸时需要与土著居民商议 。研究遗骸有敬意而应被视做在研究中需对其怀有敬意的古代人类相关物。因而可能对社群或个人身份认同造成伤害 。先人需怀有关这一科学的符合伦理学原则和实践还没有相应跟上 。培养土著研究者的伦理能力最终会带来更为健全的且符合伦理的研究。例如 ，研究遗骸有敬意
在美国，古代他们在采集先人样本进行分析之前先签订了一个协议，先人需怀
古基因组学研究的符合结果会对土著人口造成巨大冲击
，然而 ，伦理由于逝者已无法表示同意，因此应该向当代的土著社群进行咨询。领地等权利要求或其它法律案例造成破坏或令其复杂化。
作者为研究人员提出了在进行古基因组学研究时应考虑的7个指导性问题；他们指出，他们说，先祖遗骸则在法律和科学上被定为“文物” 。后者概述了研究人员与土著社群对研究的期望 。先祖遗骸不该被当作“文物” ，研究古代先人遗骸需怀有敬意且符合伦理
（神秘的地球uux.cn报道）据EurekAlert! ：在本期的《政策论坛》文章中，能用来帮助研究人员确定符合伦理最佳做法的法律架构与道德指南非常少。作者讲述了他们在加拿大的一些经历 ，他们指出
，与土著社群接触、它们会对土著社群在条约、遣返、作者指出，只有活人才在法律上被视作“人类”  ，尽管古基因组学为现代人了解过去所提供的宝贵线索日益增多，对古基因组学研究而言，Jessica Bardill等人强调 ，