它发表在《美国国家科学院院刊》上
。食物

细菌CO2浓缩机制演变的机制和潜在途径
。将二氧化碳集中在细菌体内 ,前地球早期
现在 ,大气
费舍尔说:“这是中可着古研究地球历史的一种新兴方式。蛋白细菌化学自养菌H.neapolitanus中的含氧化碳α-羧基体突变。而且倾向于与其他分子而不是蓝藻二氧化碳发生反应。以及用CA(浅棕色)包封rubisco的食物羧基体
。由于大气中的亿年意味有足二氧化碳水平在数十亿年中下降了很多,“随着二氧化碳越来越稀少 ,前地球早期使其代谢需要二氧化碳。大气
以模拟CCM结构的中可着古所有可能的进化轨迹。该团队利用构成CCM的含氧化碳20个基因改造大肠杆菌菌株 , ,蓝藻
这项研究是食物加州理工大学地球生物学教授伍德沃德·费舍尔和加州大学伯克利分校分子生物学副教授大卫·萨维奇以及霍华德·休斯医学研究所实验室之间的合作。超出rubisco本身
:CA酶(品红色)
、这篇新论文的主要作者阿维·弗兰霍尔兹说。这些细菌需要发展新的策略来提取二氧化碳
。远远高于人类气候变化导致的当前水平,在这些轨迹中可以获得CCM分量。简单地说,他们对大肠杆菌进行了基因改造,蓝藻能够创新出一种卓越的生化解决方案。“例如,这意味着古蓝藻有足够的“食物”。Ci转运蛋白(深棕色)
、它们拥有一套复杂而脆弱的结构
,以补偿较低浓度的CO2。加州理工学院的新研究揭示了CCM是如何进化的,细菌仍有足够的CO2进行代谢。从而显著影响生命的进化。为此,现代蓝藻看起来与它们的远古祖先截然不同 ,以及(ii)适当形成的羧基结构(iii)将rubisco与碳酸酐酶(CA)共包封。因为在实验室里已经建立了与大肠杆菌一起工作的基因工具
,”
在这项新的研究中 ,但可能能够以某种形式检测光。但在环境空气中无法生长,现代人类眼睛的古老前身并不具备眼睛的所有功能 ,升高的HCO3−通过仅位于那里的CA活性转化为高的羧基CO2浓度 ,删除和调整基因,”。当蓝藻处于高浓度CO2环境中时,缺乏羧基体CA(ΔcsosCA)或羧基体形成所需的非结构化蛋白质(Δcsos 2)的菌株未能在环境空气中生长
,原始的CO2固定细菌就不需要CCM 。让我们通过严格的实验室实验来测试其进化轨迹。
地质测量表明 ,因此
,并系统地添加 、
“我们认为进化是循序渐进的,
但在地球数十亿年的历史中,资料来源:《美国国家科学院院刊》(2022)
。
CCM让进化生物学家感到困惑
,DOI:10.1073/pnas.2210539119
(神秘的地球uux.cn)据美国物理学家组织网(作者:California Institute of Technology):蓝藻是一种单细胞生物,”加州理工学院博士后学者、使用这种模型系统更容易
。
费希尔说
:“这些结果突出了全球变化和地球生物圈演化之间无所不在的对话 。因为它们如此微妙地改变了编码CCM各个部分的20个基因中的任何一个,就没有明确的途径表明它们是如何进化到现在的复杂性的 。现代蓝藻已经进化出一种CCM,(B) 缺少编码基本CCM成分的基因的突变体在升高的CO2中生长,大气中的二氧化碳浓度已经下降
,但在5%CO2(>108个菌落形成单位/ml)中生长健壮(C)我们认为CCM由三种功能组成 ,所以与蓝藻本身相比
,因此为了生存,如本文所示
,这促进rubisco的羧化。
通过这种方式,负责向早期地球注入氧气,称为CO2浓缩机制(CCM)
,”
。使研究人员能够系统地对不同版本的细菌进行实验,但是 ,Rubisco不太擅长它的工作——它的反应很慢,如果CO2水平足够高 ,”细菌CCM通过三个主要特征的协同作用发挥作用——(i)细胞膜上的无机碳(Ci)转运蛋白,解决了进化地球生物学领域的一个长期谜团。并提高rubisco的效率
。”

来源:Flamholz等人2022
蓝藻在一种名为rubisco的酶的帮助下“吃掉”二氧化碳。并揭示可能的进化途径
。通过光合作用将大气中的二氧化碳(CO2)和液态水(H2O)转化为可呼吸的氧气和构成细胞的蛋白质等碳基分子,都会导致整个结构失效。蓝细菌是地球历史上最早进行光合作用的生物,有了CCM,远高于与外部环境的平衡
。Flamholz和他的团队发现,“我们可以在实验室中复制现代生物,(A) 今天,然后,我们试图在实验上区分六个连续轨迹(虚线箭头),从而从光中获取能量。事实上有几种生物学上可行的轨迹导致了复杂的现代CCM的出现
。这项新的研究利用遗传技术来模拟现代生物的远古祖先 ,这不是问题;rubisco可能效率低下 ,团队着手对CCM结构可能的古代迭代进行建模。Ci摄取导致细胞内HCO3浓度高,每一个新基因都会增加一些新功能,30亿年前地球早期的大气中可能富含二氧化碳 ,